垂体虽小，发生的疾病却不少，最多见的是垂体肿瘤。垂体肿瘤绝大部分是良性的，根据肿瘤细胞能否产生激素分为功能性垂体瘤和无功能性垂体瘤两大类。功能性垂体瘤又以肿瘤细胞生产的激素种类不同分为生长激素瘤，表现为巨人症或肢端肥大症；泌乳素瘤；促肾上腺皮质激素瘤，表现为柯兴综合征；以及其它少见的肿瘤。功能性垂体瘤生产的激素大大超过正常，就出现激素过多的病征。垂体激素产生不足的疾病也有不少，如垂体性诛儒（生长激素不足）、性腺功能低下（促性腺激素不足），有时整个垂体前叶功能都受损，多种激素分泌不足，如产后大出血引起的席汉综合征。垂体后叶功能低下的病有尿崩症（抗利尿激素不足）。
下丘脑-脑垂体疾病包括种类：尿崩症、产后垂体前叶功能减退、溢乳症及闭经-溢乳综合症、侏儒症（幼年分泌生长激素过少）、巨人症（幼年分泌生长激素过多）、肢端肥大症（成年分泌生长激素过多）。
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