存在于细胞质中，是一种细长形的含RNA蛋白，信号识别颗粒SRP由6条多肽链（SRP54, SRP19, SRP68, SRP72,SRP9, SRP14），300多个碱基的7S RNA组成。SRP相对的两端，可分为两个主要的功能单元，分别是S区域和Alu区域。S区域包括了SRP19、SRP54、SRP68和SRP72，其功能是识别信号序列以及与SR相互作用。Alu区域包括SRP9、SRP14组成的异质二聚体，主要作用是翻译延伸逮捕。P54包括了3个功能域，分别叫做N，G和M。在其C-末端，富含甲硫氨酸残基，存在信号序列的结合位点。P68和P72对于蛋白的移位起重要作用，而P9和P14位于SRP另一端，具有阻止新合成的肽链延长的功能。在SRP中部，靠近P68处，RNA具有核糖核酸酶的酶切位点。SRP的结构组成是行使其功能的分子基础。
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