短路保护其实也是过电流保护的一种，只不过当系统短路以后，电流理论上会变成无限大，这样产生的热量也是无限大，如果要等到软件反应过来再保护，锂动力电池包可能已损坏，因此，对于短路保护一般是采用硬件来自动触发，触发后传递给控制IC一个信号即可。
当锂动力电池包P+与P-输出电流超过短路电流值，并达到短路延时，控制电路控制放电开关管关断放电回路，停止放电。短路保护是过电流保护的一种极限形式，其控制过程及原理与过电流保护一样，短路只是在相当于在P+、P-间加上一个阻值小的电阻（约为0Ω）使保护板的负载电流瞬时达到设定值，保护板立即触发短路保护。
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