肌球蛋白（myosin）是沿着肌动蛋白丝轨道运动的分子马达超大家族，最初是由Kuehne在1864年研究骨骼肌收缩时发现并命名的。在最初试图要寻找非肌肉肌球蛋白，首先发现了单头肌球蛋白，随后是传统的双头肌球蛋白。后来，将前者称为“肌球蛋白I”，后者“肌球蛋白Ⅱ”。从此之后，根据发现的时间顺序用罗马数字给肌球蛋白命名，真核细胞中的肌球蛋白可以分为从I到XXXV的35类肌球蛋白种类。
依据来源，可以将肌球蛋白分为两类：传统的肌球蛋白和非传统的肌球蛋白。传统的肌球蛋白指那些构成肌肉的肌球蛋白，也就是肌球蛋白Ⅱ，最早发现于动物细胞的肌肉组织和细胞质中，主要为肌肉收缩提供驱动力，能够把ATP水解释放出来的化学能转化为肌肉收缩的机械能。但是非肌肉细胞中也存在肌球蛋白Ⅱ，称为非肌肉肌球蛋白Ⅱ。非传统的肌球蛋白指的是那些肌肉中不含有的肌球蛋白，如肌球蛋白I、Ⅲ、ⅣV、V，等只存在于非肌肉细胞之中；肌球蛋白VⅢ，Ⅺ和xⅡ只存在于植物当中。
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