HA2多肽的氨基末端即为融合体,对热敏感。当PH为中性时,HA2多肽的第76~126位区域形成一个较大的α螺旋;第56~75位区域形成半环状结构;第33~55位23个氨基酸残基形成另外一个较小的α螺旋。当PH 降至5.0~6.0时,HA2多肽的空间构型发生不可逆性改变,第 40~105位区域形成一个大的α螺旋,并向前推进约 10 nm(100A)。这使原来藏在HA蛋白 三维结构内部的融合肽暴露,并靠近细胞膜,虽然目前对融合过程的机制尚不完全明了,但推测融合肽移位后可插入细胞膜内,进而介导病毒包膜与胞内体膜融合。