蓖麻毒蛋白是糖蛋白异二聚体，是由全毒素、毒类素、凝集素三种物质组成的蛋白质，并由数种不同类型的高分子蛋白质组成，其分子式为：-[C8H8N2O2]n-，分子量64000左右，也有报道为36000～85000。已发现的结晶型有已发现的类型有：结晶型（2种）、B1型、T3型、G型、D型，中国和日本生产的小蓖麻还有E型。其中以D型毒性最强（比其它型的毒性强10-20倍）。
蓖麻毒蛋白的氨基酸组成（质量百分比）如下：赖氨酸-1.5%，撷氨酸-2.9%，甘氨酸-2.0%，异亮氨酸-3.6%，组氨酸-0.9%，色氨酸-0.8%，亮氨酸-3.8%，苯丙氨酸-2.3%，苏氨酸-2.%，肤氨酸-1.6%，天冬氨酸-10.3%，蛋氨酸-0.9%，谷氨酸-6.8%，精氨酸-12.7%，丝氨酸-8.2%。由此可见蓖麻毒蛋白中精氨酸、天冬氨酸、丝氨酸和谷氨酸的含量较多。 而A链色氨酸200、精氨酸180、谷氨酸177、酪氨酸123和酪氨酸80在氨基酸序列中是几个保守的非极性氨基酸，它们对稳定活性中心起了一定的作用。由于A链的赖氨酸的含量低，所以可防止泛素化和泛素介导的蛋白酶水解，有研究证明赖氨酸被移除不会影响A链的活性、结构、稳定性，如果在上面附加4个赖氨酸残基，A链的降解速度会明显加快。
蓖麻毒蛋白为白色粉末或结晶型固体，无味，不溶于乙醇、乙醚、氯仿、甲苯等有机溶剂，溶于稀酸或盐类水溶液，在饱和的硫酸铵溶液中能沉淀析出。在沸水中或加压蒸汽处理可使Ricin凝固变性，失去毒性，但在干热的情况下变性很小。蓖麻毒蛋白在蓖麻籽中含量为1%～5%，也有含量为0.5%～15%的报道，其在蓖麻的根、茎、叶中也有一定含量。热榨油形成的蓖麻粕中Ricin活性趋近于零，而在冷榨油形成的蓖麻粕中Ricin活性较高，因此Ricin在蓖麻粕中活性取决于榨油方式。与一般蛋白质相比，Ricin对热、酸、碱比较稳定，在半乳糖溶液中可以保存数月而不失活。
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