单克隆抗体和多克隆抗体的最大的区别在于特异性上的差别。因此实验中如果对抗体的特异性有一定的需求，但并不是特别强调的话，可以选择定制多克隆抗体，这样的实验一般包含Western-Blot(WB)，IP等。如果您需要抗体用于流式细胞术时，那么最好选择单克隆抗体。
另外，在研究很多新的蛋白时，并不确定新蛋白是否很重要，是否会是将来很长一段时间的研究重点，所以抗体用量也不大。在定制新的蛋白的抗体时，我们强烈建议首先制备多抗用于实验，当得到了理想的实验结果并需要长期的使用该抗体时再考虑制备单抗。
最后，一般修饰性抗体大多数研究员会选择定制多克隆抗体，比如甲基化抗体等，这主要是从抗体的制备难度上来考虑的。
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