链激酶不良反应发生率较低。常见不良反应如下。
1．发热、寒战、恶心呕吐、肩背痛、过敏性皮疹；链激酶静滴时可发生低血压,如血压下降应减慢滴注速度；过敏性休克罕见。
2．出血,穿刺部位出血,皮肤淤斑,胃肠道、泌尿道或呼吸道出血；链激酶用于急性心肌梗死溶栓治疗时,脑卒中的发生率为0.1%～0.3%。
3．其他反应,链激酶用于急性心肌梗死溶栓治疗时可出现再灌注心律失常,偶见缓慢心律失失常、加速性室性自搏性心律、室性早搏或室颤等；偶可引起溶血性贫血、黄疸及丙氨酸氨基转移酶（ALT）升高；溶栓后可发生继发性栓塞,如肺栓塞、脑栓塞或胆固醇栓塞等。
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