相同点
固有免疫和适应性免疫是相辅相成的、密不可分的。固有免疫往往是适应性免疫的先决条件，如树突状细胞和吞噬细胞吞噬病原生物实际上是一个加工和提呈抗原的过程，为适应性免疫应答的识别准备了条件。适应性免疫应答的效应分子可大大促进固有免疫应答，如抗体可促进吞噬细胞的吞噬能力，称为调理吞噬，或促进NK细胞的细胞毒作用；又如，许多由T细胞分泌的细胞因子可促进参与固有免疫应答细胞的成熟、迁移和杀伤功能。
不同点
固有免疫与适应性免疫应答二者之间有以下几点不同。
1在获得形式上：固有免疫是固有性的或先天性的，无需抗原激发即可获得。而适应性免疫应答却是获得性的，须在接触抗原后获得。
2.发挥作用时间：固有免疫在抗原出现的早期即可快速（数分钟～4天）发挥作用。而适应性免疫应答需在4～5天发挥作用。
3.固有免疫是模式识别受体；适应性免疫应答是特异性识别抗体，由于细胞发育中基因重排产生多样性。
4.固有免疫无免疫记忆；适应性免疫有免疫记忆性，并产生记忆细胞。
5.固有免疫包括抑菌物质、杀菌物质、补体、炎症因子、吞噬细胞、NK细胞、NK T细胞。适应性免疫包括T细胞、B细胞。
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