蓖麻毒素（约占蓖麻蛋白的5%，分子量约为66kD）是一种Ⅱ型异二聚体核糖体失活蛋白，由核糖体失活酶（蓖麻毒素A链）及与半乳糖/N-乙酰半乳糖胺特异结合的凝集素（蓖麻毒素B链）组成，二者之间连接一个二硫键。对蓖麻毒素的一级结构进行分析发现，A链含有267个氨基酸残基，分子量约为32kD，具有催化活性，是蓖麻毒素蛋白的效应链。A 链中N端第4位及C端附近分别含有1 个赖氨酸（Lys）残基，是蓖麻毒素A链毒性作用的关键中心。B链具有两个结构域，这两个结构域具有同源性，由基因复制产生。结构域1中含有氨基末端，而结构域2中含有羧基末端。蓖麻毒素B链由267个氨基酸残基组成，具有结合活性，是蓖麻毒素的结合链。
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