乳酸克鲁维酵母是生物技术科学领域非常重要的非酿酒酵母之一，其意义主要体现在两个方面:在食品行业中安全应用的历史和工业规模化生产酶的能力。1993年，第一次有文献综述了其作为异源蛋白表达系统的应用，文中提及了已有8种蛋白在这一系统中成功获取表达。到今天，这一数量己增长到40多种。
乳酸克鲁维酵母作为蛋白表达系统在食品行业的成功应用，意味着其也可以应用于医药行业进行大规模的药用蛋白的生产。事实上，许多药用相关蛋白已在乳酸克鲁维酵母中成功表达，比如哺乳动物蛋白白介素1-P、干扰素α、β-乳球蛋白、溶菌酶和胰岛素前体等。在医药领域的应用，乳酸克鲁维酵母(和其他酵母、真菌表达系统一样)的一个缺点就是对分泌的蛋白都会进行一定的糖基化修饰，并且这种修饰与人体内糖基化模式是不同的，这会对药用蛋白的半衰期、组织分布和免疫原性产生不利的影响。当然，通过改变酵母体内糖基化的方式，使其生产的蛋白能够满足人体内的糖基化模式，是可以使药用蛋白发挥效果的，这一有前景的技术对于乳酸克鲁维酵母也是适用的。
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