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真核生物的转录终止，是和这类转录后修饰密切相关的。真核mRNA3’端在转录后发生修饰，加上多聚腺苷酸(polyA)的尾巴结构。大多数真核生物基因末端有一段AATAAA共同序列，再下游还有一段富含GT序列，这些序列称为转录终止的修饰点。
真核RNA转录终止点在越过修饰点延伸很长序列之后，在特异的内切核酸酶作用下从修饰点处切除mRNA，随即加入polyA尾巴及5’-帽子结构。余下的继续转录的一段核苷酸序列，但因无帽子结构的保护作用，很快被RNA酶所降解。
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