有两种ADA同种型：ADA1和ADA2。
ADA1存在于大多数体细胞中，特别是淋巴细胞和巨噬细胞中，它不仅存在于胞质溶胶和细胞核中，而且还存在于与二肽基肽酶-4（aka，CD26）连接的细胞膜上的外胚层中。ADA1主要参与细胞内活动，并且以小形式（单体）和大形式（二聚体）存在。小型到大型的相互转换受肺中“转换因子”的调节。
ADA2首次在人类脾脏中发现。随后在包括巨噬细胞在内的其他组织中发现它与ADA1共存。这两种同种型调节腺苷与脱氧腺苷的比例，增强了寄生虫的杀灭。ADA2主要存在于人血浆和血清中，并且仅作为同型二聚体存在。
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