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物理图是指标明一些界标(例如,限制酶的切点、基因等)在DNA上的位置,图距以物理长度为单位,例如染色体的带区、核苷酸对数目等。人类基因组计划的研究目标是,构建人的每条染色体的STS图,标记之间相距约10Okb。
获得一组组DNA片段的克隆,组内两两片段之间有共同的重叠序列;或是获得标记按正确次序排列、相互毗邻的片段,其连续长度超过2000kb,以便把染色体分段进行研究。