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基因指纹，是遗传学上的概念。有完全个体特异的DNA多态性，其个体识别能力足以与手指指纹相媲美，因而得名。
可用来进行个人识别及亲子鉴定，同人体核DNA的酶切片段杂交，获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹，这种图纹极少有两个人完全相同。
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