（1）判断方法不同：
1、激发波长是用某种波长的光激发出荧光,这种波长的光可以是紫外光或者可见光也可以是其他光。
2、发射波长是指某种光发射出来的荧光的波长,一般的可见光的波长用肉眼就能大致判断出来。
（2）分辨率不同：
1、激光波长对于杂散光和信噪比的影响非常显著，当狭缝的宽度不变时，用氩激光514.5nm比用488.0nm波长激发样品，杂散光可能会小一至二个数量级（在±100cm-1范围内），且分辨率会有所提高。
2、发射光谱是指光源所发出的光谱。当发生连续光谱光源的光通过某一种吸收物质时，通过光谱仪就可以得到吸收光谱。吸收光谱是指在连续发射光谱背景中所呈现出的暗线。
（3）用途不同：
1、激发光谱可以分析在不同激发波长下，物质的特定波长荧光的强度变化。荧光激发光谱的形状与发射波长无关。
2、发射光谱是固定激发波的波长，测定发射光强度与波长（有时候也测波数或者频率等）的关系，通俗而不太严谨地说，发射光谱测定的是发射光的颜色。
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