有c及c1都是线粒体细胞色素，二者的光谱性质十分近似，二者的辅基和与酶蛋白的联接方式都相同。c1单体分子量为38 000，c1是以多聚体存在，无论是单体还是多聚体，都不能与aa3起反应。细胞色素c是分子量最小的细胞色素，由于它的分子量小，是可溶的，容易提取纯化，所以研究比较多，对其结构也最清楚，已测定50多种生物的细胞色素c的一级结构，对它的高级结构也进行过详细研究。脊椎动物的细胞色素c由104个残基组成。植物的细胞色素c由112个残基组成。人及黑猩猩的细胞色素c完全一样，尽管各种生物的细胞色素c的残基有许多变化。但其立体结构则基本一致。
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