①菌种以及确定的种子培养基和发酵培养基的组成;
②培养基、发酵罐和辅助设备的灭菌;
③大规模的有活性、纯种的种子培养物的生产;
④发酵罐中微生物最优的生长条件下产物的大规模生产;
⑤产物的提取、纯化;
⑥发酵废液的处理。
因此,有必要不断进行研究以逐步提高整个发酵过程的效率。如在一个发酵过程建立之前,生产菌株必须分离出来,通过改造使其合成日标产物,并且其产量应具有经济价值;应确定微生物在培养上的需求,并设计相应的没备;同时必须确定产品的分离提取方法。
此外,整个研究计划也应包括在发酵过程中不断地优化微生物菌种、培养基和提取方法。