本病病死率极高，早期诊断与及时治疗十分必要。目前尚无肯定有效药物，据国外有一成功的报道，静脉滴注与鞘内注射高剂量的两性霉素B(amphotericin B)和咪康唑(miconazole)联合使用可能有效，具体方法是患者被确诊后立即应用两性霉素B1.5mg/(kg·d)，分2次静脉缓慢滴注(每次不少于1h)，3天后改为1mg/(kg·d)，共用6天；必要时可同时鞘内注射，0.5mg/次。由于两性霉素B毒性较大、不良反应较多，必须十分谨慎使用，在治疗过程中应检测血清肌酸酐及尿素氮，防止出现肾功能损害。咪康唑剂量为350mg/m2体表面积，等分3次静脉滴注，共9天。口服利福平或静脉滴注磺胺异?唑(sulfisoxazole，SIZ)可增加疗效。一般抗阿米巴药物无效。
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