1.脑电图
以弥漫性或局限性异常慢波背景活动为特征，少数伴有棘波、棘-慢复合波。慢波背景活动只能提示异常脑功能，不能证实病毒感染性质。某些患者脑电图也可正常。
2.脑脊液检查
外观清亮，压力正常或增加。白细胞数正常或轻度增多，分类计数早期可为中性粒细胞为主，之后逐渐转为淋巴细胞为主，蛋白质大多正常或轻度增高，糖含量正常。涂片和培养无细菌发现。
3.病毒学检查
部分患儿脑脊液病毒培养及特异性抗体测试阳性。恢复期血清特异性抗体滴度高于急性期4倍以上有诊断价值。可通过PCR检测脑脊液病毒DNA或RNA帮助明确病原。
4.影像学检查
MRI对显示病变比CT更有优势。主要是确定或排除其他疾病，病脑时可显示脑部弥漫性水肿或局灶性异常。单纯疱疹病毒脑炎往往有局灶性改变，儿童EBV脑炎可显示有不同部位的异常信号。影像学检查正常不能除外脑炎。
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