免疫沉淀法的主要类型

个别免疫沉淀法(IP)：用来分离某个细胞萃取物中的已知特定蛋白质

免疫共沉淀法(Co-IP)：研究整个蛋白质复合体

染色质免疫沉淀法(ChIP)：用来研究DNA上的特定蛋白质

RNA免疫沉淀法(RIP)：和ChIP相近，但RNA免疫沉淀法是用来研究会与RNA结合的蛋白质

RIP技术（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA结合蛋白免疫沉淀），是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能帮助我们发现miRNA的调节靶点。RIP这种新兴的技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用，但由于研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物，RIP实验的优化条件与ChIP实验不太相同（如复合物不需要固定，RIP反应体系中的试剂和抗体绝对不能含有RNA酶，抗体需经RIP实验验证等等）。RIP技术下游结合microarray技术被称为RIP-Chip，帮助我们更高通量地了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。