口服FTY720在实验动物器官移植中具有免疫抑制活性，并能迅速、持久地减少血中T淋巴细胞数。研究表明，FTY720主要通过以下方面减少外周血中的淋巴细胞。
1 诱导淋巴细胞凋亡
Suzuki等在体外将大鼠脾细胞与FTY720共同培养，琼脂糖凝胶电泳发现染色体DNA梯形条带形成，在电镜下亦观察到染色体浓集、凋亡小体形成等明显的凋亡征象[7]。不少学者认为，FTY720导致外周血淋巴细胞减少主要是其诱导凋亡的结果。FTY720诱导淋巴细胞凋亡的机制尚未完全清楚，但已知这种凋亡不依赖于Fas-FasL途径，因为Fas基因缺失的MRL lpr/lpr小鼠也可被FTY720诱导凋亡，与Fas基因表达正常的MRL野生型小鼠无明显差异 [8]。有人证明，通过影响bcl-2/bax比值，可能是FTY诱导凋亡的机制之一，因为在体外用FTY处理人类淋巴细胞后，细胞内Bcl-2蛋白表达下降，而Bax蛋白上调[8]。此外，FTY也可通过激活磷脂酶C，引起细胞内Ca++的释放，继而诱发凋亡。FTY720还可直接影响线粒体，通过降低线粒体膜跨膜电位触发通透性转变，诱导进一步的凋亡事件，并且，这种凋亡可被泛Caspase抑制剂Z-VAD-FMK所抑制，表明Caspase活性亦为FTY720诱导凋亡所必需[9]。
2 加速外周循环的成熟淋巴细胞归巢
虽然FTY720在体外确实可以诱导淋巴细胞凋亡，然而，单纯用诱导凋亡还难以解释FTY720在体内抑制免疫的机制。因为在体外实验，FTY720诱导凋亡需要达到4×10-6M以上的浓度，而在体内则难以达到如此高的浓度，实际上，给犬按5mg/kg/d用FTY720,血药浓度仅能达到0.58×10-6M左右。而在远低于诱导凋亡所需浓度时，FTY720即可发挥明显的免疫抑制作用。为此，不少学者转向研究FTY720的其它作用机制。有学者观察到，大鼠在口服小剂量 FTY720（0.1mg/kg）后，在外周血淋巴细胞明显减少的同时，外周淋巴结及派尔结（Peyer Patch）的淋巴细胞显著增加[10]，因此推测FTY720可通过促进循环淋巴细胞向周围淋巴器官转移（淋巴归巢）导致外周血淋巴细胞减少[10,11,12]。对细胞黏附分子如选择素、整合素、趋化因子的调节可能是这种转移发生的机制，因为应用针对经典的黏附分子L-selectin、CD11a、CD49d的联合抗体可以有效地抑制FTY720处理导致的大鼠加速外周淋巴细胞向淋巴结转移的作用[10]。具体的机制尚未彻底弄清。有人发现FTY720增强 T细胞归巢趋化因子SLC（secondary lymphoid chemokine）和ELC(EBI1 ligand chemokine)引起的T细胞迁移[12] ，SLC和ELC都是趋化因子受体CCR7的配体，后者是一种表达在天然和活化T细胞上的G蛋白偶联受体（GPCR）。而在SLC/ELC缺失的plt/plt突变小鼠，FTY720不能减少血中T细胞，这些提示，FTY720在体内可通过影响趋化因子介导的淋巴细胞归巢减少外周血淋巴细胞数。这也可以解释为什么FTY720仅选择性作用于外周血中的淋巴细胞。
3 抑制T细胞从胸腺向外周血循环的转移
有学者研究发现，长期每日按1 mg / kg剂量口服FTY720导致胸腺内成熟髓内T细胞(CD4(+)CD8(-) 和 CD4(-)CD8(+))比例增加3－4倍，双阳性细胞轻微减少。表型分析(TCRalpha beta, H-2K(d), CD44, CD69 and CD24)表明，这些增加的亚系代表可能向外周转移的胸腺细胞。对胸腺内的细胞标记FITC，与对照组小鼠相比，只有1/4标记细胞能在FTY720处理小鼠的淋巴结和脾检测到[13]。这些结果提示，FTY720的免疫抑制作用至少部分是由于抑制T细胞从胸腺向外周的转移所致。 3 独特的作用机制以及和其它免疫抑制剂的协同作用 虽然FTY720可以使天然和活化的CD4和CD8 T细胞及B细胞从血液进入外周淋巴结和派尔结，但与淋巴细胞清除药物不同的是，它不会永远消灭这些细胞。给正常大鼠单次口服FTY720 0.1mg/kg-10mg/kg，在用药3小时内外周淋巴细胞数明显下降，在1到2周后完全恢复正常[7]。
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