移植能否成功，在很大程度上取决于供者与受者的组织相容性。所谓组织相容性，就是指不同个体间进行组织或器官移植时，移植物与宿主是否能相互“容忍”。如能“容忍”移植物就能存活，否则，移植物将被排斥或移植物使宿主受损。供受两者的组织相容性如何，是由组织相容性抗原决定的。组织相容性抗原分为：
(1)主要组织相容性抗原 其免疫原抗性较强，所引起的免疫排斥反应发生得快且强烈，在移植免疫中主要涉及的是主要组织相容性抗原。
(2)次要组织相容性抗原
其免疫原性较弱，引起的免疫排斥反应发生得慢而弱。但其重要性也不可忽视，因为由于组织配型技术的进展，可在一定程度上控制主要组织相容性抗原引起的免疫排斥反应，而对次要组织相容性抗原了解甚少，尚无法控制。
(3)其他参与排斥反应发生的抗原 如人类ABO血型抗原，组织特异性抗原，内皮细胞抗原，SK抗原，种属特异性糖蛋白抗原
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