自体干细胞移植主要分为两步，即自体干细胞的采集和干细胞的移植。
在临床上根据自体干细胞采集的方法不同分为骨髓干细胞移植和外周血干细胞移植。前者先在无菌条件下采集患者自体骨髓350～500ml，通过分离、纯化等过程，制成含有足够数量干细胞的细胞悬液；后者是给患者注射4-5天粒系集落刺激因子，以动员骨髓干细胞进入外周血，使其在外周血中达到一定数量，再用血细胞分离机分离出需要的干细胞进行移植。
我们以糖尿病和糖尿病足为例来说明干细胞的移植的过程：
利用自体干细胞移植治疗糖尿病时，我们将用以上方法制备好的干细胞悬液通过动脉导管迁移到胰腺组织中，在胰腺组织微环境的诱导下分化增殖为胰岛样细胞并分泌胰岛素。
在治疗糖尿病足时，自体干细胞移植的方法有两种：下肢肌肉局部注射和下肢动脉导管注射。两种不同的移植方法在临床上均取得了满意疗效。
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