链球菌的分类方法有多种，常见的有以下3种：
1.根据溶血现象分类可分为3类
(1)甲型溶血性链球菌(α-hemolytic streptococcus)：这类链球菌亦称为草绿色链球菌(streptococcus vividans)，是人类上呼吸道的正常菌群，只有在受损的心瓣膜、脑膜上或泌尿生殖道中能引起疾病，为条件致病菌。
(2)乙型溶血性链球菌(β-hemolytic streptococcus)：此类链球菌亦称为溶血性链球菌(hemolytic stretococcus)。乙型溶血性链球菌致病力强，常引起人和动物多种疾病。
(3)丙型链球菌(γ-streptococcus)：不产生溶血素，菌素周围无溶血球，故亦称不溶血性链球菌(non-hemolytic streptococcus)。无致病性，常存在于乳类和粪便中，有时偶尔引起感染。
2.根据抗原结构分类 按链球菌细胞壁中的特异性C多糖抗原不同，可分为A、B、C、D……等18族。对人致病的链球菌，90%属于A族。同族链球菌之间因表面蛋白不同又可分若干亚型，如A族链球菌，根据其M抗原不同可分为80个亚型，A族链球菌亦称为化脓性链球菌。
3.根据对氧的需要分类 分需氧性、兼性厌氧性、厌氧性链球菌3类。对人类致病者主要为前两类。
以上分类法以抗原结构分类法最合理。
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