1.黏膜下段输尿管纵形肌纤维有缺陷 致使输尿管外移，黏膜下段输尿管缩短，从而失去抗反流的能力。正常黏膜下段输尿管的长度与其直径的比例为5∶1，而有反流时仅为1.4∶1。
2.输尿管开口异常 也是反流的原因。运动场形、马蹄形和高尔夫球洞形的输尿管开口都容易发生反流。
3.膀胱内压升高 当下尿路梗阻（尿道狭窄和前列腺增生症的晚期）或神经源性膀胱造成膀胱内尿液潴留时，膀胱内压升高破坏了膀胱输尿管连接部的抗反流机制，产生反流。
4.先天性输尿管发育异常 输尿管旁憩室、输尿管囊肿、输尿管开口于膀胱憩室、异位输尿管开口等输尿管异常也可造成膀胱输尿管回流现象。
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