需注意手术治疗时可能出现呼吸功能障碍加重或呼吸衰竭。
1.颅底凹陷症常合并齿状突异常，并使齿状突突入颅后窝，进而压迫桥延脑和颈髓，用Halo环行颈牵引治疗有症状的患者多可恢复。
2.颅底凹陷常合并Chiari畸形，如骨结构在腹侧压迫延颈髓，在行颅后窝减压前需先行腹侧减压，解除腹侧结构对延髓的压迫；当出现脊髓空洞或积水时仍应行颅后窝减压术，前路减压后脊髓空洞和积水多可消退，骨压迫去除后神经症状可得到改善。
3.继发的颅底凹陷或颅底压迹是骨软化的结果，应行减压术合并骨融合或支架固定牵引，对骨发育不全、Paget病、Haudju-Cheney综合征的治疗主要是应用支架牵引固定。
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