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当自噬体与溶酶体结合后，受溶酶体内酸性环境影响，黄色荧光又逐渐变成红色荧光，再加上溶酶体自带的蓝色荧光标志（CTSD），最后形成的自噬溶酶体呈现紫色荧光，这是酸化功能正常的自噬溶酶体。如果溶酶体酸化功能障碍，则融合后自噬体黄色荧光不变红，加上溶酶体自带的蓝色荧光标志，最后形成的自噬溶酶体呈现白色荧光，这是酸化功能障碍的自噬溶酶体。
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