采收
一般栽培6年左右收获。有经验的药农为使根茎粗壮分枝多，每年在植株基部培土1—3厘米，从薄到厚逐年增加，这样挖出的生药呈褐黄色如鸡爪。秋季采挖，除去须根及泥沙，晒干或烘干，撞去残留须根。形如鸡爪，命名为“鸡爪黄连”。根茎长3－6厘米。表面灰黄色，粗糙，有不规则结节状隆起，有须根残茎，偶有平滑茎杆。质硬，断面不齐，木部鲜黄色，呈放射状排列，髓部有的中空。气微，味极苦。
炮制
将鲜黄连直接置于炕房内炕干。当炕至黄连一折就断时，趁热放入槽笼内来回撞击，撞去附着的泥沙、须根及叶柄，即成干黄连。 在中国唐代有炒法。中国宋代有酒炒、姜炒、蜜制、米泔制、麸炒、制炭、吴茱萸制、巴豆制等炮制方法。中国元代增加了土炒、童便制等法。中国明、清以后又增加了醋制、盐制、乳制、黄土姜酒蜜制、胆汁制，酒萸制等方法。并对其炮制目的有较多阐述，如：黄连入手少阴心经，为治火之主药，治本脏之火，则生用之，治肝胆之实火，则以猪胆汁浸炒，治肝胆之虚火，则以醋浸炒，治上焦之火，则以酒炒，治中焦之火，则以姜汁炒，治下焦之火，则以盐水或朴硝研细调水和炒，治气分湿热之火，则以茱萸汤浸炒，治血分块中伏火，则以干漆末调水炒，治食积之火，则以黄土研细调水和炒。现行，有酒洗、酒拌、姜汁拌、吴茱萸拌、酒炒、醋炒、盐水炒等炮制方法。 炮制方法为：净制除去杂质。润透后切薄片，晾干，或用时捣碎。
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