1、妊娠期用药
无阿糖胞苷用于怀孕妇女的研究。已知本品对一些动物种属有致畸作用。对已经或可能怀孕妇女使用本品前需考虑对孕妇和胎儿潜在的利弊。建议育龄期妇女避孕。
怀孕期间接受过阿糖胞苷（单独或与其他药物联合应用）治疗的孕妇，可以分娩正常的婴儿，但也有可能是早产儿或低体重儿。一些接触过阿糖胞苷的正常婴儿从出生后六周开始随访一直到七岁，并未发现异常。有一名似乎正常的婴儿在出生90天时死于胃肠炎。
有先天性畸形的报道，特别是当胎儿在妊娠前3个月内接触了全身应用的阿糖胞苷时。此类畸形包括上肢和下肢远端缺损以及手足和耳的畸形。
宫内接触阿糖胞苷的婴儿，在新生儿期有发生全血细胞减少，白细胞减少、贫血、血小板减少、电解质异常、短暂的嗜酸眭粒细胞增多、IgM水平增高和高热、脓毒血症及死亡的报道。这些婴儿中也有部分是早产儿。
对接受阿糖胞苷治疗的孕妇曾施行过治疗性流产。尽管有胎儿正常的报道，但其他报告均显示对胎儿有影响，这种影响包括脾肿大和绒毛膜组织中C组染色体三体异常。
因为细胞毒药物潜在的致畸作用，特剐在妊娠早期（最初的三个月），应将对胎儿潜在的危险性和是否适宜继续怀孕告知已经或可能怀孕的应用本品的患者。如果治疗开始于怀孕中后期，仍存在致畸危险，但相对较小。虽然有在怀孕全程均接受治疗的患者仍分娩正常婴儿，但应建议对这些婴儿进行随访。
2、哺乳期用药
目前尚不知道药物是否从人乳汁中分泌。由于许多药物可从人乳汁中分泌，而且阿糖胞苷对哺乳婴儿具有潜在的严重不良反应，必须根据药物对母亲的重要性来决定是否停止哺乳或停用药物。
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