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一般原则是检测器不低于250℃，柱温不应高于当前使用色谱柱的最高温度，不低于室温，进样口不低于进样物质中沸点最高物质再加50℃的温度。此外进样口和检测器温度不要低于柱温，防止产生逆向气压气体回流进样口以及色谱柱填料流失污染检测器，就是说柱温较高时应提高检测器和汽化室的温度。还有，检测器的温度超出色谱柱最高使用温度不要太多，因为色谱柱末端会插入检测器喷嘴，插入长度一般较长，高温下柱固定相流失严重，影响基线甚至会出现波动和鬼峰。
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