咽部神经支配极为丰富，感觉和运动神经主要来自咽后壁的咽丛，含有迷走、舌咽、副神经和颈交感神经的分支，此外尚有三叉神经第二支、舌咽神经等，直接分布于咽部，故咽部感觉极为灵敏。全身许多器官的疾病，也可通过神经的反向和传导作用，使咽部发生异常感觉。故咽异感症产生的机制较为复杂，致病因素繁多，可分为局部、全身和精神体质三个方面：
1.局部因素
无论原发性或者继发性，凡病变累及咽腔或者咽壁的任何一层组织，使咽部神经受到刺激，就会引起咽异感症。
（1）咽部疾病 如各型咽炎、慢性扁桃体炎，扁桃体的结石、息肉、角化、囊肿、瘢痕及脓肿，舌扁桃体炎，悬雍垂过长，鼻咽、口咽及喉咽的异物、瘢痕、肿瘤，舌根部静脉曲张、囊肿、肿瘤、茎突综合征，咽部憩室等。与职业有关的咽炎如粉尘性、化学性咽炎，也是咽异感症的病因。
（2）邻近器官的疾病 鼻部及鼻咽部疾病如鼻窦炎、鼻咽炎。喉部疾病如喉上神经炎、风湿性环杓关节炎、会厌囊肿、会厌形态异常、喉软骨膜炎、血管神经性喉水肿、环咽肌及咽下缩肌痉挛等。食管疾病如食管痉挛、憩室、失弛缓症、早期恶性肿瘤、外伤性食管炎、反流性食管炎、贲门痉挛、横膈裂孔疝等。颈部疾病如颈部肿块、瘘管、淋巴结炎、甲舌囊肿、甲状腺炎症、肿瘤及其他如牙病、耳病、颈症候群、舌咽神经痛、颈动脉炎等，均可引起本病。
2.全身因素
迷走神经在胸腔和腹腔诸器官中有着广泛的分布，这些脏器的病变都可能引起咽部异常感觉。
（1）远离器官的病症 如胃及十二指肠炎或溃疡、胃癌、幽门痉挛、胆石症、左心扩大、高血压性心脏病、心包炎伴积液、主动脉瘤、屈光不正等。
（2）全身疾病 以代谢、内分泌疾病多见，如维生素缺乏症，缺铁性贫血，甲状腺疾病如甲状腺机能亢进或减退，绝经期综合征，重症肌无力，颈椎骨关节炎，关节僵直及肠寄生虫等病。
3.精神因素
精神和情绪的变化，对于咽异感的发生和发展有着明显的影响，如神经衰弱、神经官能症、精神分裂症、恐癌症、癔病及焦虑、抑制状态等。这可能和间脑，尤其是丘脑下部的机能有关。
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