1、检查：取脓液和组织液镜下可见棕色和黑褐色菌丝与酵母样孢子。培养可生长出褐色和黑色绒毛样或酵母样菌落。组织病理可见多数分隔、黑色壁的菌丝，直径为1.5～3微米，偶可见分支或酵母样芽生孢子，菌丝周围有炎性细胞或多核巨细胞浸润，无厚壁孢子。
2、鉴别诊断：需与着色芽生菌病、异物肉芽肿、皮肤利什曼病、透明丝孢霉病等鉴别。KOH检查，培养和组织检查可以确诊。
3、预后：系统性暗色丝孢霉病预后差，常导致死亡。在饮食上一般要慎用海味、蛋类、豆类以及刺激性饮食，还应清淡饮食。随访及反复的培养和组织病理检查很有必要。
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