2023年11月30日，上海市科学技术委员会发布《关于上海市2023年度“科技创新行动计划”计算生物学重点专项项目立项的通知》。详细内容如下：
各有关单位：
根据《关于发布上海市2023年度“科技创新行动计划”计算生物学重点专项申报指南的通知》（沪科指南〔2023〕14号）要求，经申报推荐、形式审查、专家评审、立项公示等程序，现对《构建单细胞尺度的跨模态组学智能集成的多模态预训练大模型及其关键计算技术研究》等15个项目予以立项，市科委资助3595万元，其中2023年拨款3235.5万元。请各项目承担单位做好项目组织实施和管理工作，确保按期完成项目研究任务目标。
特此通知。
2023 年度上海市“科技创新行动计划” 计算生物学重点专项项目立项清单
| 序号 | 项目编号 | 项目名称 | 项目承担单位 | 项目负责人 | 项目实施周期 |
| 1 | 23JS1401100 | 构建单细胞尺度的跨模态组学智能集成的多模态预训练 大模型及其关键计算技术研究 | 同济大学 | 刘琦 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 2 | 23JS1401400 | 单细胞多模态谱系追踪算法 | 中国科学院脑科学与智能技术卓越 创新中心 | 陈跃军 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 3 | 23JS1401300 | 样本特异动态网络标志物方法 | 中国科学院分子细胞科学卓越创新 中心 | 陈洛南 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 4 | 23JS1401200 | 构建转录调控网络基础模型 | 同济大学 | 张勇 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 5 | 23JS1400300 | 基于人工智能技术的 RNA 转录后调控网络解析及功能 预测模型构建 | 复旦大学上海医学院 | 杨力 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 6 | 23JS1400100 | 细胞器互作多模态分析系统的建立及其在疾病研究中的 应用 | 复旦大学 | 乔亮 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 7 | 23JS1401500 | 基于时空变异演化网络的病原微生物大模型构建及应用 | 中国科学院上海营养与健康研究所 | 张国庆 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 8 | 23JS1400200 | 基于序列和结构进化模型以及局部微环境的蛋白质及核 酸结构预测和设计算法 | 复旦大学 | JIANPENGMA | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 9 | 23JS1400600 | 蛋白质工程通用 AI 设计平台 | 上海交通大学 | 洪亮 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 10 | 23JS1400700 | 精准医学大数据分析增强计算系统 | 上海交通大学 | 吕晖 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 11 | 23JS1401000 | 基于智能健康数字队列孪生体的高发突发疾病预警预防 研究 | 上海市疾病预防控制中心 | 夏天 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 12 | 23JS1400800 | 肿瘤队列多层次数据集成共性技术 | 上海交通大学 | 李婧 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 13 | 23JS1400900 | 基于 20 万中国人大型疾病队列的多层次多模态数据融 合分析与建模 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | 陆洁莉 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 14 | 23JS1400400 | 靶向组装 MHC 单倍型精准解析类风湿性关节炎遗传致 病性 | 复旦大学上海医学院 | 刘贇 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
| 15 | 23JS1400500 | 精准医学大数据共性统计学习理论、算法与应用 | 华东师范大学 | 周勇 | 2023.12.01 至 2026.11.30 |
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