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差异验证方法全解

2017.9.13

中科新生命,成立于2004年,专注于质谱技术方法在科技服务、生物医药、精准医疗领域的应用开发。12年质谱服务经验,每年处理样本数超万例,通过与中科院的技术合作及企业研发团队的自主创新,致力成为您优秀的生物技术合作伙伴。

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本篇文章是差异蛋白主题系列的最后一篇,之前的内容可以点击以下链接查看:

【老生常谈】P值是如何来的!

【REVIEW】你从哪里来,差异蛋白!

终于找到你 | 挑选差异蛋白攻略大全


定量蛋白组学技术,包括非标记的定量蛋白质组学(Label-free定量)和体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术(iTRAQ定量),可以筛选两组样本(实验组和对照组)之间的差异蛋白。差异蛋白质也有了,生物信息学分析也做了,是否发文章就万无一失了呢?NO!NO!NO!还是那句话,经得起考验的才是真爱啊。所以如果有发表文章的需求的您,强烈建议您对结果进行验证,具体原因可以查看之前发的:【老司机切磋】蛋白质组学与验证,您所关心的问题都在这里 

好奇的您要问了,那选择哪一种验证方法呢?目前,随着科学技术的发展,生物学也迎来了日新月异的时代,在技术层出不穷的时候,如何进行验证,今天我们就为您总结一下。


1.    PRM验证。PRM也是大家的老朋友了,生物质谱平行反应监测技术(简称PRM),  它是对复杂混合物中目标蛋白质进行准确质谱检测的技术手段。PRM作为一种蛋白质谱检测的方法,具有特异性强灵敏度高准确度高重现性好线性动态范围宽自动化高通量的突出优点,是目前最灵敏的质谱检测模式,被誉为蛋白质谱分析的“金标准”,其技术应用之一就在于可以进行差异蛋白后续验证。相比以上几种验证方式,能兼顾以上方法的缺点,并且通量更高的验证小能手也非PRM莫属了。在经常在编审的评审意见中也经常推荐使用PRM验证的方法啦。所以还不知道什么是PRM的童鞋,请戳链接去学习一下。

新神器来袭:PRM技术——蛋白质组学验证,无缝对接!!


2.    WB验证。目前确实很多文章是用的该方法来进行的验证,但是需要准备特异性的抗体,而且,有越来越多的文献提到,WB不足以验证质谱鉴定到的差异蛋白。因为WB实验是级联放大效应,针对组与组之间表达差异比较大的蛋白,可能会有比较好的验证效果。但如果是质谱鉴定出来有差异,但是是差异比较小蛋白,WB经常是验证不出来的。另外大家要注意了,抗体验证前提是要有抗体噢,但是市面上的抗体种类不可能覆盖所有的蛋白质种类,所以可能还需要先合成您所需要的个性化抗体才可以噢,这个成本和时间可是大大滴。所以WB验证也不是万能的方法哟。

3.   酶联免疫吸附测定enzyme linked immunosorbent assay(简写ELISA): 利用抗原抗体结合专一性进行免疫反应的定性和定量检测方法。定性测定的结果判断是对受检标本中是否含有待测抗原或抗体作出"有"或"无"的简单回答。定量的结果可以根据标准曲线的制定,结合吸收度值进行定量结果的判断。但是ELISA试验要选择适合的Kit才能的到比较可信的结果呢。


4.  RT-PCR验证。如果核酸水平与蛋白水平有一致的改变,那可以使你的结果锦上添花,如果核酸水平无变化,你反而还要花力气去研究其原因,或给出解释。所以RT-PCR验证属于不同的层面的验证,不一定是一致的结果。试验操作较为简单,成本相对较低,但是如果有不一致的结果也不要奇怪噢,有可能就是这样的。


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更多活动内容请看:【开学大促销】蛋白质组学验证PRM买一送一!

 

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