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使用重组的果蝇因子进行染色质装配实验2

2019.4.11
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zhaochenxu

致力于为分析测试行业奉献终身

重组染色质装配反应中的核心组蛋白与 DNA 比率的滴定



实验材料

见基本方案

试剂、试剂盒

见基本方案

仪器、耗材

见基本方案

实验步骤


1. 按照基本方案 6 步骤 1~6 操作。


要得到真实浓度的近似值,DNA 的浓度由 A260 值计算得到,组蛋白的浓度通过 BCA 分析系统来确定。


2. 按如下所述进行 5 个装配反应:


2.1 在 56.6 ul NH 中(见基本方案 6 步骤 3)加入 1 ul ACF(2~10 U)。


2.2 从冰上取下管子,平衡到室温。


2.3 加入 10.5 ul AM 主混合液(见基本方案步骤 4),及 2.5、2.22、2.0、1.82、 1.67 ul DNA 模板(使用过量的拓扑异构酶Ⅰ变松弛或超螺旋的;见基本方案步骤 5)。马上轻轻地涡旋混匀 2~3 S。


2.4 27℃ 装配 1.5~2.5 h。


3. 按照基本方案步骤 8~12 操作。


4. 从凝胶上分析确定组蛋白与 DNA 最高量的比值,这时仍然能观察到未弥散的梯度。使用下一个最低的比值作为进行进一步装配反应的最理想的比值。重新计算核心组蛋白的有效浓度以使新的最佳比值为 1.0:1。

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