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RT-PCR实验步骤

2019.7.29
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zhaochenxu

致力于为分析测试行业奉献终身

一、组织抽提:

1.       取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末

2.       移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆

3.       移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打

4.       冰上孵育5分钟

5.       离心12,000g  4  5分钟 取上清液移入1.5ml新离心管

6.       0.2 ml氯仿,震荡,冰上孵育5分钟

7.       离心<12,000g  4  10分钟 取上层液相移入1.5ml新离心管

8.       0.5 ml异丙醇,震荡,冰上孵育5分钟

9.       离心<12,000g  4  5分钟 弃去上清液

10.   加入1 ml 75%乙醇,震荡

11.   离心<7,500g  4  5分钟 弃去上清液

12.   室温下使之变透明

13.   加入DEPC处理水10μl --35μ溶解RNA 可保存在液氮或低温冰箱)

14.   RNA变性电泳观察18s28s条带,分光光度计检测260/280吸光度比值,计算RNA浓度

 

 

 

 

二、RT反应体系(第一步):约20分钟

RNA    抽提物

5μl

Radome 引物

2μl

RNA sin

0.5μl

1.       65 15分钟

2.       立即放入冰浴

RT反应体系(第二步):约2小时

RNA sin

0.5μl

10mM  dNTP

1μl

5×RT  缓冲液

4μl

25mM  MgCl2

4μl

AMV  逆转录酶

3μl

1.       37 1.5小时

2.       94 5-10分钟

3.       反应物保存于-20℃或进行PCR

1PCR反应体系:约4.5小时

25mM  MgCl2

2μl

10×PCR 缓冲液

5μl

10mM  dNTP

1μl

上下游引物10pmol/μl

2.5μl×2

CDNA模板

2.5μl

ddH2O

34μl

Taq

0.5μl

轻质石蜡油

50μl


100μl

1.       94 2分钟,55 1分钟,72 2分钟 为第一个步1个循环

2.       94 45秒,55 40秒,72 1分钟 为第二步30个循环

3.       72 10分钟

4.       取出后4 5分钟后-20℃保存或走电泳

2PCR反应体系:约5小时

25mM  MgCl2

3μl

10×PCR 缓冲液

5μl

10mM  dNTP

1μl

上下游引物10pmol/μl

2.5μl×2

CDNA模板

5μl

ddH2O

30μl

Taq

1μl

轻质石蜡油

50μl


100μl

1.       94 2分钟,55 1分钟,72 2分钟 为第一个步1个循环

2.       94 45秒,50 40秒,72 1分钟 为第二步40个循环

3.       72 10分钟

4.       取出后4 5分钟后-20℃保存或走电泳

四、电泳:约1.25小时

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