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C.elegans基因文库的分类和选择

2019.12.19
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184****5725

致力于为分析测试行业奉献终身

自 1995 年成立以来,Dharmacon 在生物信息学,RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。

作为 RNA 定制合成的领导者,Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者,并且在若干重要的科学发现中,以及确保沉默效率的 siRNA 试剂的商业化过程中做出了重大贡献。Dharmacon 公司保持技术进步,利用生物信息学和化学修饰提高产品性能,从而维持了长久以来 siRNA 领域的领先性。当今,我们研究的领域和研究工具已经扩展到支持 RNA 干扰应用的方方面面;如,siRNA,慢病毒shRNA,microRNA 研究工具,以及对基因,microRNA 和 lncodeRNA 进行功能性筛选的全基因组文库。同样,在过表达研究应用中,Dharmacon 公司收集了齐全的商业化 cDNA 和 ORF 文库。

秀丽隐杆线虫(Caenorhobditis elegans)是一种重要的生物学研究模式生物,在细胞凋亡和RNA干扰(RNAi)方面取得了突破性进展。
 

文库种类

     Dharmacon线虫资源包括多个线虫基因组文库,包括ORF文库、RNAi文库、转录因子文库和启动子文库等。除此之外,Dharmacon 针对Caenorhobditis elegans 研究领域提供了Zoonome siRNA 文库。

线虫(Caenorhobditis elegans)基因cDNA&ORF文库     

(1)        线虫ORFs库(C.elegans ORF Collection)

        秀丽隐杆线虫ORF文库是功能性秀丽线虫蛋白质组基因文库,它由一组预测的蛋白质编码开放阅读框(ORFs)组成,这些开放阅读框已克隆Gateway-供体载体中。该线虫ORF文库可用于表达约11000种线虫蛋白。通过高通量策略和大规模相互作用图谱进一步研究线虫蛋白表达,可深入了解线虫的蛋白质功能。

(2)        线虫RNAi文库(C. elegans RNAi Collection)       

        源于秀丽线虫ORFeome文库v1.1,秀丽线虫RNAi文库提供了11000多个RNAi克隆,全面覆盖筛选范围。这些克隆被整合到pL4440-dest-RNAi目的载体中,以大肠杆菌饲养菌株 HT115(DE3)甘油菌形式保存。在RNAi 浸润或注射,可以作为体外合成dsRNA的模板。

(3)        线虫启动子文库(C. elegans Promoter Collection)

        该文库包含6000多个秀丽隐杆线虫基因的预测启动子,这些基因已被克隆到Gateway重组载体中,从而构建启动子融合结构。这种线虫“启动子组”的潜在应用包括构建启动子-GFP融合体,用于获得蛋白质表达图谱和亚细胞定位,以及芯片和酵母单杂交分析。通过启动子与线虫ORF文库结合,还可用于组织特异性RNAi、亚细胞蛋白定位和异位(ectopic)表达研究。

(4)        线虫转录因子(C. elegans Transcription Factors)

        此文库包含755个线虫转录因子ORFs,约占全部预测的线虫转录因子的80%,并已克隆到Gateway兼容的Y1H“猎物”载体pDEST-AD中,可用于酵母单杂交(Y1H)和双杂交(Y2H)检测.

 Zoonom siRNA (线虫)


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