LncRNA研究发表的成果五花八门，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量数据，发表5分影响因子的文章，还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础，让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上发表。
研究背景
Folic Acid(FA, 叶酸)，在促神经管发育等方面的作用而被广大备孕青年们使用。然而，除了这方面的用处外，现在的研究也发现，叶酸可以预防肥胖引起的心血管和代谢异常。但是，其中的内在分子机制是什么？本研究就是通过小鼠模型，高脂喂育加叶酸下，小鼠心脏中lncRNA和mRNA的变化分析，解释了叶酸对胖子们心血管方面的影响。
研究结果
1. 模型表型分析
研究人员通过对照组（SD），高脂喂育组（HFD）和叶酸加高脂喂育组（HFDF）模型，比较了12周以后的体重变化。结果显示，HFD和HFDF组差别不大，但是HFD组比对照SD组显著增高，糖耐受也增加。此外，HFD组的血浆瘦蛋白相比HFDF组显著升高。因此，肥胖组，叶酸肥胖组还是存在着表型上的差异。
2. 差异lncRNA和mRNA筛选
为探究叶酸培养肥胖组的内在RNAs表达变化，研究人员利用小鼠lncRNA表达谱芯片（伯豪生物提供），对HFD和HFDF组进行了差异筛选。结果显示，共有220个lncRNA表达异常（122个上调，98个下调），共有101个mRNA表达异常（88个上调，13个下调）。
3. 差异mRNA功能分析
那么，这些差异的100多个mRNA主要参与哪些生物学功能和信号通路呢？GO富集分析显示，这些基因主要涉及到转运，细胞发育和代谢过程；pathway富集分析显示，主要涉及到“细胞因子-细胞因子受体互作”、“破骨细胞分化”、“MAPK 信号通路”、“代谢通路”和“叶酸生成”等，和炎症，能量代谢和细胞分化相关的信号通路。
4. 共表达分析挖掘lncRNA生物学功能
为挖掘异常表达的lncRNA的生物学功能，研究人员分别对HFD组和HFDF组的差异lncRNA与mRNA进行共表达网络分析，比较两组之间变化大的RNAs。结果显示，Dnajb1, Egr2, Hba-a1, NONMMUT033847, NONMMUT070811, NOMMUT015327变化显著。而这些差异基因的功能，也主要是细胞因子-细胞因子受体互作”、“破骨细胞分化”、“MAPK 信号通路”、“Jak-STAT信号通路”等。因此，这些变化的lncRNA可能是通过影响这些信号通路影响肥胖者的心血管功能。
5. QRT-PCR验证
研究人员最后对上述筛选到的mRNA和lncRNA进行了qRT-PCR验证。结果显示，验证数据和芯片数据高度一致。因此，叶酸可能是通过这些lncRNA和相关基因影响肥胖者的相关生理机能。
研究结论
本研究通过一个非常巧妙的实验设计，深入分析和挖掘了叶酸对于肥胖来说引起的lncRNA和mRNA变化。并通过共表达分析探讨lncRNA的潜在生物学功能。该研究条理清晰，简单明了，是非常不错的lncRNA研究。
原文出处：
Ma,
F., W. Li, R. Tang, Z. Liu, S. Ouyang, D. Cao, Y. Li and J. Wu (2017).
Long Non-Coding RNA Expression Profiling in Obesity Mice with Folic Acid
Supplement. Cell Physiol Biochem ,2017,42(1): 416-426.
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