分析测试百科网

搜索

喜欢作者

微信支付微信支付
×

应用Target MS2 方法对大鼠血浆中人重组干扰素进...(二)

2020.5.18
头像

王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

3 结果分析

3.1 筛选定量肽段

首先使用Q-Exactive 对人重组干扰素α-2b 标准品的酶解肽段进行Full MS/ddMS2 扫描,上样量为500ng(不计酶解损失),筛选人重组干扰素α-2b 的unique peptide,该肽段必须为人重组干扰素α-2b 所特有的肽段,才可以用于表征人重组干扰素α-2b 的量。

 

下图展示的为人重组干扰素α-2b 色谱质谱的原始图,图中可见,整个色谱峰分离比较均一,强度比较高。

 

2017112152526338.jpg

 

将上述得到的原始文件使用Byonic 软件进行搜库处理,观察蛋白质的序列匹配度,数据库使用DrugBank 下载的人重组干扰素α-2b 的氨基酸序列。

 

2017112152546816.jpg

 

从上述表格可见,人重组干扰素α-2b 的氨基酸序列匹配度达到了98.18%,说明Q-Exactive 的超高灵敏度,在不到500ng 的上样量的情况下可以对蛋白质进行高氨基酸序列匹配度的分析,对于后续数据分析的可靠性非常重要。

下图展示的是人重组干扰素α-2b 的具体氨基酸序列匹配情况。图中绿色标记的氨基酸序列为鉴定到的氨基酸,红色标记的为鉴定到的带有修饰的氨基酸,黑色标记的为实验中没有鉴定到的氨基酸。

 

2017112152632243.jpg

2017112152648281.jpg

 

从上述图中可以看出,165 个氨基酸中只有最后三个氨基酸没有被鉴定到,分析发现162 位的氨基酸为R,因而在Trypsin 的酶解中会被切割,产生的肽段为最后三个氨基酸,该肽段过短,不适于质谱检测。

 

从上述的色谱质谱原始图中可以看出在洗脱时间为36.28min,m/z 为451.75 的色谱峰其强度最高, 搜库

结果显示该色谱峰为人重组干扰素α-2b 的unique peptide“EDSILAVR”,下图展示的是EDSILAVR(m/z 451.75)的母离子色谱质谱抽提峰及其二级谱图,

 

2017112152755320.jpg

 

下图为上述的肽段EDSILAVR 二级谱图的解析情况,图中可见所有的y 系列离子均被鉴定到,子离子的实测m/z 与理论m/z 偏差均在10-3 水平,谱图质量非常高,结果非常可信。另外,从二级谱图中可以看出,二级碎片子离子y4 ,m/z 458.31,其强度最高,因而在随后的数据分析中选取451.75- 458.31 这一母离子- 子离子对来表征EDSILAVR的含量,进而表征人重组干扰素α-2b 的含量(该方法即为选择反应监测技术:SRM Selected Reaction Monitoring)。

 

2017112152825397.jpg

 


互联网
仪器推荐
文章推荐