做了很久的WB(western blot),走了很多弯路,其实发现WB想要做好并不难,总结了WB实验中可能会遇到的问题,分析了可能的原因及对应的解决方案,希望能成为你实验成功的基石。
问题1:转膜不充分
(1)膜没有完全均匀湿透
使用100% methanol浸透膜。
(2)靶蛋白分子量小于10 000
选择小孔径的膜,缩短转移时间。
(3)靶蛋白等电点等于或接近转移缓冲液pH值
可尝试使用其他缓冲液如CAPS缓冲液(pH 10.5)或使用低pH值缓冲液如乙酸缓冲液。
(4)甲醇浓度过高
过高甲醇浓度会导致蛋白质与SDS分离,从而沉淀在凝胶中,同时会使凝胶收缩或变硬,从而抑制高分子量蛋白的转移。降低甲醇浓度或者使用乙醇或异丙醇代替。
(5)转移时间不够
对于厚的胶以及高分子量蛋白需要延长转移时间。
问题2:背景高
(1)膜没有完全均匀湿透
使用100% methanol浸透膜。
(2)洗膜不充分
增加洗液体积和洗涤次数。
(3)阻断不充分
增加封闭液孵育时间,或者提高温度。选择合适的封闭试剂(脱脂奶粉,BSA,酪蛋白等)。
(3)二抗浓度过高
降低二抗浓度。
(4)检测过程中膜干燥
保证充分的反应液,避免出现干膜现象。
(5)曝光过度
缩短曝光时间。
(6)抗体与阻断蛋白有交叉反应
检测抗体与阻断蛋白的交叉反应性,选择无交叉反应的封闭剂。洗涤液中加入Tween-20可减少交叉反应。
问题3:没有阳性条带
(1)抗体染色不充分
增加抗体浓度,延长孵育时间。
(2)酶失活
直接将酶和底物进行混合,如果不显色则说明酶失活了。选择在有效期内、有活性的酶联物。
(3)标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低
设置阳性对照,如果阳性对照有结果,但标本没有则可能是标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考虑增加标本上样量解决靶蛋白含量低的原因。
(4)试剂不匹配
一抗与组织种属,一抗与二抗或/和底物与酶系统之间不匹配。通过设置内参照可以验证二级检测系统的有效性。
(5)一抗失效
选择在有效期内抗体;并选择现配现用的工作液。
(6)HRP抑制剂
所用溶液和容器中避免含有叠氮化钠。