肺系病的发生发展与痰邪密切相关。比如咳嗽一病，分为外感咳嗽和内伤咳嗽。引起内伤咳嗽的主要病理因素是痰与火，而痰又有寒热之分。
哮病是肺系病的常见病，其发生的重要机制是痰邪，朱丹溪曾言：“哮喘专主于痰”，从而有“无痰不成哮”一说。苗祥东用健脾除湿的名方参苓白术散治疗哮病取得良好疗效，肯定了积痰是哮喘发作之源。刘永平整理古代哮病文献后发现痰在支气管哮喘发作期是重要的致病因素，缓解期痰的表现虽不明显，甚至无痰，但体内仍有伏痰，易受多种因素诱发。故痰是哮喘发病的原因。李学良也认为，痰实为哮喘的主要病理基础，是哮喘发作的中心环节。
喘证的发生，主要脏腑在肺肾，性质分为虚实两端。其中实喘多由外邪、痰浊、肝郁气逆，邪壅肺气，宣降不利所致。黄崇先从痰饮角度论治肺源性心脏病表现为喘证的患者，取得良好疗效。认为喘证一病的病机特点是“感邪时偏于标实，平时偏于本虚”，临床中标实者以痰浊水饮为主。刘建秋对肺间质纤维化表现为中医喘证的疾病病机进行了探讨，认为主要发病机制是气虚血瘀、痰热互结。外邪、痰浊、瘀血、热毒为标实，痰热壅肺型是常见证型。
肺痈一病，重要的内伤病机即为痰热素盛。痰阻肺络，血滞为瘀，导致痰热与瘀血互结蕴酿成痈，血败肉腐化脓，肺损络伤，脓疡溃破外泄。已故老中医何任认为，肺痈之证，总由于感受风寒未经发越，停留于肺蕴发为热，或由湿热痰浊蒸淫肺窍而成。所以，痰邪在肺痈发病中也有重要机制。
肺胀的发生，缘于多种慢性肺系疾病反复发作，日久不愈，出现肺气胀满，失于敛降，最终形成的一种病证。该病的病理因素主要为痰浊、水饮与血瘀互为影响，兼见同病。三种病理因素中痰浊居首，故有人将其病机概括为六个字“肺脾肾，痰水瘀”，所以无痰也不成胀。韩圣宾也认为，肺胀一病病理因素主要为痰浊、水饮与瘀血，兼见同病，早期以痰浊为主，渐而痰瘀并见。黄崇先认为痰饮既是肺胀的病理产物，又是致病因素。曹宗黎认为COPD患者，多为痰湿体质，素体肥胖，又根据“肾为生痰之根”、“脾为生痰之源”、“肺为贮痰之器”及“胃者，五脏之本也”的思想，提出痰饮水湿，同属一物观点。单丽囡认为该病主要病理因素为痰浊与瘀血，两者相互影响，兼见同病，是疾病发生及发展的重要环节。
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