Tm值的影响因素如下：
（1）G—C的含量：在一定条件下Tm高低由DNA分子中的G-C含量所决定。G-C含量高时，Tm值比较高，反之则低。这是因为G-C之间的氢键较A-T多，解链时需要较多的能量之故。
Tm值和G-C的含量可用二一个经验公式表示：
（G—C）%=（Tm-69.3）×2.44
在一定条件下（pH7.0，0.165MNaCl中）Tm值与（GC）%含量呈正比关系。因此，通过测定Tm值，可以推算出DNA分子中的碱基百分组成。
（2）DNA所处的溶液条件：DNA溶液中离子强度低时，Tm较低，而且熔解温度范围较宽；离子强度较高时，Tm较高，熔解温度范围较窄。因此，在表示某一来源DNA的Tm值时，必须指出其测定条件。
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