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咽喉部的活组织检查主要是为了明确咽喉部可能出现的新生物的性质，或者是对于一些咽喉部存在的较为难以判断其疾病种类的情况进行诊断。
例如患者的咽喉部位出现了明显的不适，且在进行咽喉镜检查或者是咽喉部位的CT等影像学检查时，发现了咽喉部位出现了明显的新生物。且不能够准确地判断其性质或是根据其现有的特征，考虑其具有一定的恶性倾向。这种情况下就建议进行活组织检查来明确良恶性质，同时对疾病的属性进行定性。
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