一个波形蛋白单体，与其他中间丝相似，有着一个中央α螺旋结构域，在前端盖著一个非螺旋的胺基，及于末端盖著一个羧基。两个单体会互相扭曲，形成一个卷曲螺管形状的二聚物。两个二聚物会进一步形成一个四聚物，再与其他四聚物相连成为一片。
α螺旋序列包含一组疏水的氨基酸，这组氨基酸在螺旋表面形成一层“疏水性屏障”。这度屏障容许两个螺旋互相卷曲。再者，当中有著周期性分布的酸性及碱性氨基酸，能平衡卷曲螺旋二聚物。在带电苛的剩余物之间距是最佳建立离子盐桥的地方，同样能稳定α螺旋结构。有科学家认为这道盐桥不但可以提供内链的相互作用，当它由盐桥转为离子外链连结时，可以造成中间丝。
科学家发现波形蛋白是附在细胞核、内质网及线粒体的旁边或末端，因而相信波形蛋白在支撑及锚固原生质内的细胞器有着重要的角色。它亦能维持细胞的形状、细胞质的完整性及稳定细胞骨架内的相互作用。
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