当今已发现3种BFT异构体,即BFT-1,BFT-2和BFT-3。BFT-1、BFT-2分别由ETBF VPI 13784、86-5443-2-2菌株合成、分泌。BFT-3(Korea-BFT)由Chung和Kato分别于1999年、2000年从韩国和日本分离的ETBF菌株中发现,BFT-1和BFT-2具有92%的相同氨基酸序列,主要差异为:
(1)用高辨析率阴离子交换柱纯化BFT时,洗涤时所用的NaCl溶液浓度不同,表明两者所带的净电荷量不同;
(2)体外实验表明,F、BFT-2对HT29/C1细胞系的生物活性化BFT-1微弱而持久;
(3)二者在SDS-PAGE时表现出不同的电泳特性;
(4)二者的抗原性也存在一定的差异。BFT-3与BFT-1、BFT-2分别有21和11个氨基酸的差异,氨基酸序列分析表明BFT-3与BFT-2关系更加密切,主要表现为用高辨析率阴离子交换柱纯化BFT时洗涤所用的NaCl溶液和SDS-PAGE时电泳特性相同,但BFT-2缺乏存在于BFT-3C末端的具有疏水,亲水两重性的区域现已有人报道从欧洲分离的ETBF检测到BFT-3,但检出率显著低于亚洲地区,提示BFT具有一定的地区特异性。