1.绝对禁忌证
严重心肺功能不全、休克、腹主动脉瘤、急性腹膜炎、肠穿孔等。
2.相对禁忌证
（1）妊娠、腹腔内广泛粘连及各种原因导致肠腔狭窄者、慢性盆腔炎、肝硬化腹水、肠系膜炎症、肠管高度异常屈曲及癌肿晚期伴有腹腔内广泛转移者等，如果必须检查时，由有经验的术者小心进行；
（2）重症溃疡性结肠炎，多发性结肠憩室患者应看清肠腔进镜，勿用滑进方式推进结肠镜；
（3）曾做腹腔尤其盆腔手术、曾患腹膜炎以及有腹腔放疗史者进镜时宜缓慢。轻柔，发生剧痛则应终止检查，以防肠壁撕裂、穿孔；
（4）体弱、高龄病例，以及有严重的心脑血管疾病、对检查不能耐受者，检查时必须慎重；
（5）肛门、直肠有严重化脓性炎症或疼痛性病灶、对检查不能耐受者，检查时必须慎重；
（6）小儿及精神病或不能合作者不宜施行检查，必要时可在全麻下施行；
（7）妇女月经期一般不宜做检查。
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