1. 抗-C-100出现较晚，约半数输血后丙型肝炎病人于输血后4～6个月抗-C-100首次阳转，因此，不宜作为急性丙型肝炎的常规实验室诊断；
2.抗-C-100不是中和抗体，也不是lgM抗体，而是lgG 抗体；
3.本法不够灵敏，少数丙型肝炎病人检测不到抗-C-100；
4.有非特异性，一些自家免疫性慢性肝病患者可出现假阳性，因此，抗HCV阳性需作重组免疫印迹试验(Recombinant Immune Blot Assay, RIBA, 或称 Western Blot)证实。
由于HCV核心抗体出现较早，因此，最近美国第二代酶联免疫试验法（ELISA）检测抗HCV。该试剂盒采用HCVC区编码蛋白C-22-3和非结构区NS3编码蛋白C-33-3和C-100-3包被载体。用本法检测抗HCV，其检出率可提高25～30%，且检出抗HDV的时间也可提早16～42天。
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