纤支镜检查对疑难的原发型肺结核诊断具有重要意义。可以直接采集痰标本、刷检和灌洗液进行病原学检查（结核分枝杆菌培养及抗酸杆菌涂片检查）。
(1)胸内淋巴结结核常侵及支气管，形成支气管结核，甚至穿孔形成淋巴结支气管瘘，纤支镜检查可确诊。
(2)肿大淋巴结造成支气管外压，未形成支气管病变者可在纤支镜下行淋巴结穿刺检查，对诊断及鉴别诊断均有重要价值。
(3)若痰菌阴性，经纤维支气管镜常可观察到气管外压或支气管受侵，进行刷检、活检及淋巴结穿刺活检有助于确诊。
儿童肺门淋巴结结核支气管异常较为常见。多为淋巴结穿孔表现，成人的支气管淋巴结结核穿孔也不少见，并且容易漏诊。
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