种类
植物疫苗
转基因植物生产疫苗 转基因植物工程是综合性的工程，尤其在疫苗研究方面，要想在FMDV转基因植物疫苗上取得实际的应用价值，还有较长的路要走，这不仅需要对 分子生物学相关方面的深入研究，而且还要对FMDV的免疫机理，尤其是对黏膜免疫的分子机制有全面地认识。可喜的是，许多科学家都在致力于该方面的研究并且取得了一定的成果，相信在不久的将来，适用的 口蹄疫转基因植物疫苗会更贴近于实际应用。
由于转基因植物基因工程疫苗具有许多优点因此，其研制与应用引起了许多国家和企业界的重视，显示出作为低成本苗生产系统的良好发展前景。目前，转基因植物疫苗的研究报道主要集中在少数植物上，由于 烟草含有毒的生物碱， 马铃薯不适合人类生食，这两种转基因植物作为人用疫苗来说，显然是不合适的，因此，开发和应用人类喜欢的，可生食的植物种做转基因宿主，是当前研制人用转基因植物疫苗的一个很重要的方面，近来发展的针对人用疫苗的香蕉转化体系，对外源基因在香蕉果实中高效表达的条件进行了研究，是一个有益的探索。
动物疫苗
对动物疫苗来说，其首选 宿主应是作为饲料的谷类，如苜蓿，玉米和豆类等作物。预计未来的转基因宿主将呈现多样化的局面，以满足不同的人,不同的动物的需求。生物技术通报Biotechnology Bulletin 2002年第2期对于抗原基因来说，只要基础研究好，市场前景广阔的均可进行研究，但其重点应首先放在研究胃肠道传染病上，因为从技术上来讲容易获得突破，从实际上来讲其应用价值也最大，特别是动物可饲疫苗的研制，应先行一步。
优点
与常规疫苗相比，植物基因工程可饲疫苗不含以人畜为宿主的致病 微生物或病毒、致癌因子、 毒素等潜在污染物质，饲喂安全，不会引起负反应，不会影响疾病监测，且使用方便，生产简便、易于储存和分发，可随时、长期、大范围给药。尤其可在候鸟迁移途中进行可饲疫苗的定点投放，从而达到有效防控 禽流感传播和蔓延的目的。
与现在使用的“注射型”禽流感疫苗相比，这种新型防控禽
流感的可饲疫苗具有使用安全方便，可大规模生产、成本较低，易于储存和分发，可随时、长期、大范围给药，一种方法可生产多价疫苗等特点，尤其可在候鸟迁移途径中进行定点投放，弥补无法对 候鸟打针的防控薄弱环节。 独特优点
(1)易于遗传操作。植物 细胞具有全能性，组织培养研究基础好， 遗传转化方法趋于成熟；
(2)生产成本低。植物是自养生物不需要复杂的设备和设施，只要有土地，就可以大规模产业化生产；
(3)易获得多价疫苗。将不同抗原基因的转基因植物进行杂交，可以很容易地获得多价转基因植物疫苗；
(4)能准确地进行翻译后加工。植物具有完整的真核细胞表达系统，表达产物可糖基化，酰基化，磷酸化，亚基可以正确装配等转译后加工等特点；
(5)无病原污染。其他技术生产疫苗，很容易发生病原性或非病原性 细菌，病毒等污染；
(6)转基因植物种子易于贮存，有利于抗原蛋白的生产和运输；
(7)使用方便。通过直接食用达到免疫，产生较强的体液和粘膜免疫反应，方法简便，易于推广普及；
(8)无须提取纯化过程。接食用免疫，若作纯制剂则要考虑。
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